Karbonhidrat, yağ ve protein sindirimi; fiziksel ve kimyasal sindirim olarak ikiye ayrılır. Büyük moleküller halinde alınan besinler, önce ağızda fiziksel sindirime uğrar. Bunun sonucunda ufak parçalara ayrılan karbonhidrat, yağ ve proteinler sindirim sisteminin farklı bölümlerinde kimyasal sindirime uğrar. Kimyasal sindirim, hormonların kontrolünde salgılanan enzimlerle gerçekleşir. Kimyasal sindirim hidroliz reaksiyonu olduğu için enzimlerle birlikte su da kullanılır. Sindirim sonucu oluşan besin monomerleri daha sonra kana emilerek hücrelere ulaştırılır.

Karbonhidratlar, bütün canlılar tarafından birinci dereceden enerji verici olarak kullanılır. Karbonhidratların sindirimi ağızda başlar. Tükürük içinde bulunan amilaz enzimi, pişmiş nişasta ve glikojene etki ederek onları maltoz ve dekstrinlere parçalar. Yemek borusundan mideye gelen karbonhidratlar, midede kimyasal sindirime uğramazlar. Mide içindeki HCl sayesinde ortam asidik olduğundan, karbonhidratların sindirimini sağlayan enzimler midede görev yapamaz.

Proteinler, yapıcı ve onarıcı olarak kullanılır; gerekirse enerji olarak da kullanılabilir. Proteinlerin kimyasal sindirimi midede başlar. Midede belirli bir basamağa kadar sindirimi yapılan proteinlerin sindirimi, daha sonra ince bağırsakta devam eder. Ağızdan gelen besinler yemek borusundan mideye geçerken pilor bölgesindeki bazı bezleri uyarır. Mide boşluğuna bezlerden salgılanan mide öz suyundaki enzimler, protein sindirimini başlatır.

Yağlar, sindirim sistemine sıvı ya da katı olarak alınır ve organizmada yapı ve enerji maddesi olarak kullanılır. Yağların kimyasal sindirimi ince bağırsakta başlar ve tamamlanır. Besin karışımı mideden ince bağırsağa geçerken onikiparmak bağırsağında sekretin ve kolesistokinin hormonları salgılanır. Sekretinin uyarısıyla pankreastan yağların sindirimi için lipaz enzimi salgılanır. Kolesistokinin hormonu ise karaciğeri uyararak onikiparmak bağırsağına safra sıvısının salgılanmasını sağlar. Safra salgısı, yağları daha küçük parçacıklara ayırarak bir çeşit mekanik sindirim gerçekleştirir.

Karbonhidrat, yağ ve proteinlerin sindirimi, vücudun enerji üretimi, yapı taşlarının sağlanması ve genel metabolik fonksiyonların yerine getirilmesi açısından kritik öneme sahiptir. Bu besin öğelerinin doğru ve etkili bir şekilde sindirilmesi, vücudun optimal işleyişini destekler ve genel sağlık durumunu korur. Sindirim sistemindeki herhangi bir aksaklık, besinlerin emiliminde ve dolayısıyla vücudun ihtiyaç duyduğu enerji ve yapı taşlarının sağlanmasında ciddi sorunlara yol açabilir.